《苍穹之法芙娜》简介：在真壁一骑和皆城总士居住的平静小岛龙宫岛，有一天突然响起了“你在那里吗？”的声音，未知生命体菲斯特姆的侵略开始了。终于，一骑等人得知29年前，由于菲斯特姆的侵略，日本列岛已经不复存在的事实。而龙宫岛实际上是为了救赎人类建造的人工要塞岛，岛上的居住的人都是曾经受到特殊训练的Alvis组织成员。 　　 得知自己深以为生活在和平年代的幻想遭到毁灭性打击的一骑等人被动的卷入了人类和菲斯特姆的生死存亡之战。少年们为了保护岛屿乘上法芙娜开始战斗。法芙娜是人类为了防御菲斯特姆的读心能力而开发的最终兵器。而驾驶法芙娜的少年们却从出生时就被注入了特殊因子在体内。在与菲斯特姆战斗的过程中，少年们体内的染色体会发生变化，也就是说，变成接近于菲斯特姆的形态而自己则缓慢的走向死亡。法芙娜就是如此恐怖的非人道的兵器。在凄绝的战斗中，驾驶员们或死或伤，不断倒下。而相信菲斯特姆可以和人类共存的Alvis的愿望也渐渐发生了改变。这时，在北极进行的人类和菲斯特姆的最终决战“苍穹作战”打响了……