恐龙宝贝之龙神勇士第三部讲述了在古老而遥远的泛古大陆，人类与恐龙和谐共处，大陆呈现一片祥和气氛和色彩。但好景不长，随着大陆的守护神----“龙神”的力量减弱，以瑞鹰为首的邪恶势力打破了和平与宁静。龙神为了拯救泛古大陆，早已将自己的力量封存在四块龙晶体，传说谁得到这四块龙晶体，就能得到无尚的力量，统治整个泛古大陆。地球少年龙翔无意中碰触爷爷的龙神手镯，穿越时空，来到泛古大陆。龙翔目睹了邪恶势力霸占森林、驱逐百姓的情景，邪恶的百合甚至用特定的药物将善良的恐龙变为他们的爪牙。为了捍卫大陆和平，阻止邪恶势力的意图，龙翔担负起了拯救泛古大陆的使命，必须抢在他们之前找到龙晶体。只有集齐四块龙晶体的力量，才能唤醒龙神，驱除邪恶。同时，龙翔也只有借助龙神的力量才能返回地球 。于是，正反双方的龙晶体争夺战一触即发……